教員情報 - 田母神　淳

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学歴

1.

2007/04～2010/03

北海道大学生命科学院生命情報分子科学コース博士課程修了博士（生命科学）

専門分野（キーワード）

キーワード：生物物理化学、物理系薬学

研究課題

1.

2005/04～

微生物型ロドプシンの分子機構の解明個人研究

教育・研究・社会貢献に関する受賞歴

1.	2021/10	日本薬学会中国四国支部日本薬学会中国四国支部奨励賞 (プロトンポンプ型微生物ロドプシンのプロトン輸送機構に関する研究)
2.	2008/03	物理系薬学部会第6回フィジカル・ファーマフォーラム 2008（PPF2008） PPF2008奨励賞
3.	2008/03	2007年度日本生物物理学会北海道支部例会優秀発表賞

所属学会

1.	2005/07～	日本生物物理学会
2.	2009/03～	日本蛋白質科学会
3.	2009/10～	日本薬学会

著書・論文歴

1.	2024/11	論文	Retinal chromophore configuration in the O intermediate of sensory rhodopsin II from Natronomonas pharaonis Biochemistry 63,pp.2714-2717 （共著）
2.	2023/09	論文	Key determinants for signaling in the sensory rhodopsin II/transducer complex are different between Halobacterium salinarum and Natronomonas pharaonis FEBS. Lett. 597,pp.2334-2344 （共著）
3.	2023/08	論文	Raman optical activity of retinal chromophores in sensory rhodopsin Ⅱ J. Phys. Chem. B 127,pp.7244-7250 （共著）
4.	2021/10	論文	Conformational analysis of a retinal Schiff base chromophore in proteorhodopsin by Raman optical activity J. Phys. Chem. Lett. 12,pp.9564-9568 （共著）
5.	2021/07	論文	Replaceability of Schiff base proton donors in light-driven proton pump rhodopsins J. Biol. Chem. 297(3),pp.101013 （共著）
6.	2021/06	著書	Functional mechanism of proton pump-type rhodopsins found in various microorganisms as a potential effective tool in optogenetics Epigenetics to Optogenetics - A New Paradigm in the Study of Biology （共著）
7.	2021/05	論文	Spectroscopic approach for exploring structure and function of photoreceptor proteins Biophys. Physicobiol. 18,pp.127-130 （共著）
8.	2018/09	論文	Low-temperature Raman spectroscopy reveals small chromophore distortion in primary photointermediate of proteorhodopsin FEBS. Lett. 592(18),pp.3054-3061 （共著）
9.	2018/07	論文	Photocycle of sensory rhodopsin II from Halobacterium salinarum (HsSRII): Mutation of D103 accelerates M decay and changes the decay pathway of a 13-cis O-like species Photochem. Photobiol. 94,pp.705-714 （共著）
10.	2018/06	論文	Interhelical interactions between D92 and C218 in the cytoplasmic domain regulate proton uptake upon N-decay in the proton transport of Acetabularia rhodopsin II J. Photochem. Photobiol. B. 183,pp.35-45 （共著）
11.	2017/03	論文	Existence of two O-like intermediates in the photocycle of Acetabularia rhodopsin II, a light-driven proton pump from a marine alga Biophys. Physicobiol. 14,pp.49-55 （共著）
12.	2016/12	論文	Photochemical characterization of actinorhodopsin and its functional existence in the natural host Biochim. Biophys. Acta (Bioenergetics) 1857,pp.1900-1908 （共著）
13.	2016/02	論文	Formation of M-like intermediates in proteorhodopsin in alkali solutions (pH > ~8.5) where the proton release occurs first in contrast to the sequence at lower pH Biochemistry 55,pp.1036-1048 （共著）
14.	2015/11	論文	Structural basis for slow photocycle and late proton release in Acetabularia rhodopsin I from the marine plant, Acetabularia acetabulum Acta. Crystallogr. D Biol. Crystallogr. D71,pp.2203-2216 （共著）
15.	2014/12	論文	The effects of chloride ion binding on the photochemical properties of sensory rhodopsin II from Natronomonas pharaonis J. Photochem. Photobiol. B. 141,pp.192-201 （共著）
16.	2013/02	論文	A study of the interaction of drugs with liposomes with isothermal titration calorimetry Journal of Biophysical Chemistry 4(1),pp.11-21 （共著）
17.	2013/02	論文	Thermodynamic parameters of anion binding to halorhodopsin from Natronomonas pharaonis by isothermal titration calorimetry Biophys. Chem. 172,pp.61-67 （共著）
18.	2012/11	論文	Photoinduced proton release in proteorhodopsin at low pH: The possibility of a decrease in the pK_a of Asp227 Biochemistry 51,pp.9290-9301 （共著）
19.	2012/03	著書	Photo-induced proton transfers of microbial rhodopsins Molecular Photochemistry- Various aspects pp.89-108 （共著）
20.	2012/01	論文	Photo-induced bleaching of sensory rhodopsin II (phoborhodopsin) from Halobacterium salinarum by hydroxylamine: Identification of responsible intermediates J. Photochem. Photobiol. B. 106(1),pp.87-94 （共著）
21.	2011/10	論文	Photochemistry of Acetabularia rhodopsin II from a marine plant, Acetabularia acetabulum Biochemistry 50(41),pp.8888-8898 （共著）
22.	2011/09	論文	Crystal structure of the eukaryotic light-driven proton pumping rhodopsin, Acetabularia rhodopsin II from marine alga J. Mol. Biol. 411(5),pp.986-998 （共著）
23.	2011/08	論文	An amino acid residue (S201) in the retinal binding pocket regulates the photoreaction pathway of phoborhodopsin Biochemistry 50(33),pp.7177-7183 （共著）
24.	2011/03	論文	Spectroscopic evidence for the formation of an N intermediate during the photocycle of sensory rhodopsin II (phoborhodopsin) from Natronobacterium pharaonis Biochemistry 50(12),pp.2135-2143 （共著）
25.	2011/01	論文	Photochemistry of a putative new class of sensory rhodopsin (SRIII) from gene xop2 of Haloarcular marismortui J. Photochem. Photobiol. B. 102(1),pp.45-54 （共著）
26.	2010/05	論文	Photoreaction cycle of phoborhodopsin (sensory rhodopsin II) from Halobacterium salinarum expressed in Escherichia coli Photochem. Photobiol. 86(3),pp.571-579 （共著）
27.	2010/04	論文	The photochemical reaction cycle and photo-induced proton transfer of sensory rhodopsin II (phoborhodopsin) from Halobacterium salinarum Biophys. J. 98(7),pp.1353-1363 （共著）
28.	2009/03	論文	A tin-oxide transparent electrode provides the means for rapid time-resolved pH measurements: Application to photo-induced proton transfer of bacteriorhodopsin and proteorhodopsin Photochem. Photobiol. 85(2),pp.578-589 （共著）
29.	2023/02	論文	プロトンポンプ型微生物ロドプシンのプロトン輸送機構に関する研究 YAKUGAKU ZASSHI 143(2),111-118頁（単著）
30.	2011/02	論文	SnO₂透明電極を用いた光受容タンパク質のプロトン移動解析生物物理 51(1),42-43頁（共著）
31.	2011/11	論文	細菌の走光性を解明するバイオメカニズム学会誌 35(4),224-232頁（共著）
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資格・免許

1.	2022/03/23	甲種危険物取扱者
2.	2005/05/18	薬剤師免許

学外審議会・委員会等への貢献

1.	2025/02～2026/01	日本薬学会中国四国支部大学選出幹事
2.	2025/04～2025/11	第64回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会実行委員
3.	2025/05～2025/05	あなたの健康、誰が守る？～未来の体をつくるセルフケア～第1回薬に関する基本的な話と食による栄養管理
4.	2021/05～2021/05	自身でできる健康管理～健康管理に役立つ生活のヒント～第1回市販薬(OTC医薬品)を活用するためのヒント
5.	2019/12～2019/12	県立宇和島南中等教育学校模擬授業「光遺伝学とは～光を利用して働く微生物のタンパク質を医療に役立てる」
6.	2019/10～2019/10	松山大学公開講座in大洲「身近にあるクスリについて考える」
7.	2017/01～2017/12	日本生物物理学会　分野別専門委員（レチノイドタンパク質）
8.	2017/05～2017/05	日本生物物理学会第9回中国四国支部大会　実行委員
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