ハタ　マサユキ   HATA Masayuki   畑　晶之    所属   松山大学  薬学部 医療薬学科    職種   准教授
発行・発表の年月	2003/01
形態種別	学術論文
標題	Molecular Dynamics Study on Class A β-Lactamase: Hydrogen Bond Network among the Functional Groups of Penicillin G and Side Chains of the Conserved Residues in the Active Site.
執筆形態	共著
掲載誌名	J. Phys. Chem. B
巻・号・頁	107,10274-10283頁
著者・共著者	Y. Fujii, N. Okimoto, M. Hata, T. Narumi, K. Yasuoka, R. Susukita, A. Suenaga, N. Futatsugi, T. Koishi, H. Furusawa, A. Kawai, T. Ebisuzaki, S. Neya and T. Hoshino
概要	クラスAβ-ラクタマーゼと抗生物質ペニシリンGとの複合体につき、分子動力学シミュレーションを行った。その結果、活性部位に存在するSer130, Asn132, Ser235, Glu237およびArg244が共同してペニシリンGを支え、その動きを制限していることがわかった。また、活性部位に存在するGlu166は基質が結合するSer70から離れすぎており、アシル化においてはgeneral baseとして機能しないことが示唆された。基質がない場合の酵素についても同様の計算を行ったところ、反応に関与する水分子が頻繁に入れ替わることもわかった。