ハタ　マサユキ   HATA Masayuki   畑　晶之    所属   松山大学  薬学部 医療薬学科    職種   准教授
発行・発表の年月	2001/01
形態種別	学術論文
標題	Molecular dynamics simulations of a complex of HIV-1 protease and substrate: substrate-dependent efficiency of catalytic activity.
執筆形態	共著
掲載誌名	J. Mol. Struct. (THEOCHEM)
巻・号・頁	543,53-63頁
著者・共著者	N. Okimoto, K. Kitayama, M. Hata, T. Hoshino and M. Tsuda
概要	HIV-1プロテア−ゼと、異なる長さを持つ複数の基質との複合体に関する分子動力学シミュレーションを行った。基質として、酵素によって切断される部位を含む6残基、7残基、9残基およびP4部分をLeuに置換した9残基ペプチドを考慮した。その結果、最初の3ペプチドは触媒反応を受けることが可能な配置を示したが、残る1ペプチドはそのような構造は得られなかった。このことは、最初の3ペプチドはHIV-1プロテアーゼと望ましいES複合体を形成すれば切断されるが、残る1ペプチドはたとえプロテアーゼと結合しても切断されないことを示唆している。