ハタ　マサユキ   HATA Masayuki   畑　晶之    所属   松山大学  薬学部 医療薬学科    職種   准教授
発行・発表の年月	2000/01
形態種別	学術論文
標題	Molecular Dynamics Study of HIV-1 Protease-Substrate Complex: Roles of the Water Molecules at the Loop Structure of the Active Site.
執筆形態	共著
掲載誌名	J. Am. Chem. Soc.
巻・号・頁	122,5613-5622頁
著者・共著者	N. Okimoto, T. Tsukui, K. Kitayama, M. Hata, T. Hoshino and M. Tsuda
概要	HIV-1プロテアーゼと基質との複合体について、分子動力学シミュレーションを行った。まず、活性部位内にある2つのアスパラギン酸（Asp25, Asp25’）のうち、どちらがプロトン化されているかを調べたところ、Asp25’であることがわかった。次にES複合体の特異的配置を維持している機構について調べたところ、活性部位のループ構造にいる2つの水分子が、その役割を果たしていることがわかった。以上のことから、HIV-1プロテアーゼの活性には蛋白部分のみならず、活性部位にある水分子も関与していることが示された。